氫氣發生器主要由電解池、開關電源、液路壓力自控、凈化、流量顯示等系統組成。氫氣的純凈度、流量和壓力對色譜儀的正常運行影響很大，因此氫氣發生器的故障應及時排除。
氫氣發生器啟動前應加氫氧化鉀電解液(稱取KOH100g溶解于1L的高純水中)，充分攪拌溶解等電解液*冷卻后再倒入儲液桶中使用，然后加入高純水不要超過上限水位線，也不要低于下限水位線，擰上外蓋。液位管中的白色東西是液位管接口處的潤滑劑，不影響使用，待整體換液后就好。
氫氣發生器產氫達不到預定的壓力，儀器顯示量超出實際使用量較大：
1.故障原因：氣路系統漏氣、過濾器或過濾器上蓋沒有擰緊、氫氣電解池反漏；
2.檢查方法：用檢漏液檢測各氣路連接處；
3.排除方法：更換漏氣元件、擰緊漏氣點、更換電解池。
氫氣發生器產氫超過預定的壓力：
1.故障原因：自動跟蹤裝置擋光板錯位或脫落、光電耦合損壞；
2.檢查方法：目測、用萬用表測量電路；
3.排除方法：前面板上的壓力達到0.3兆帕時關閉電源，把擋光板安裝在合理的位置上，打開電源開關輕輕敲緊擋光板即可、更換損壞的光電耦合元件。
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